More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2212 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  63.92 
 
 
297 aa  397  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  39.18 
 
 
287 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  39.26 
 
 
288 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  37.11 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  36.98 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  38.49 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  38.24 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  39.85 
 
 
289 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  36.09 
 
 
288 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  38.02 
 
 
290 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  38.11 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  36.43 
 
 
282 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  36.43 
 
 
282 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  36.06 
 
 
282 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  35.79 
 
 
296 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  36.8 
 
 
283 aa  155  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  38.43 
 
 
283 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  35.59 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.93 
 
 
305 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  37.88 
 
 
285 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  34.22 
 
 
304 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  36.27 
 
 
315 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  34.28 
 
 
320 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  30.93 
 
 
401 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  35.27 
 
 
309 aa  149  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.57 
 
 
311 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  34.05 
 
 
315 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  32.49 
 
 
329 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  35.04 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  30.69 
 
 
293 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  33.84 
 
 
299 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  35.14 
 
 
310 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  34.67 
 
 
279 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  35.56 
 
 
280 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  33.81 
 
 
315 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  33.95 
 
 
318 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  30.83 
 
 
293 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  30.48 
 
 
293 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  29.75 
 
 
294 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  35.53 
 
 
283 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  30.99 
 
 
291 aa  142  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  31.8 
 
 
296 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1206  agmatinase  32.96 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  33.7 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1603  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.63 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.293668  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.78 
 
 
382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  30.14 
 
 
396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  33.08 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  34.63 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.5 
 
 
385 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0897  putative agmatinase  34.72 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.322484  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  32.97 
 
 
354 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  34.59 
 
 
299 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  33.59 
 
 
287 aa  139  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  32.34 
 
 
319 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  31.79 
 
 
315 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1431  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.33 
 
 
268 aa  139  7e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  32.34 
 
 
319 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  32.34 
 
 
319 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1823  putative agmatinase  34.07 
 
 
268 aa  138  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.397511  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  32.35 
 
 
318 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  33.09 
 
 
315 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  32.48 
 
 
317 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  31.18 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  32.52 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  32.59 
 
 
315 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  38.53 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  35.09 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  31.34 
 
 
396 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  31.88 
 
 
378 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  32.73 
 
 
325 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  35.48 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  33.7 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  32.43 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  28.28 
 
 
416 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  35.09 
 
 
294 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  31.16 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  32.84 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  32.58 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  32.58 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  32.74 
 
 
345 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  32.97 
 
 
333 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1626  agmatinase  34.72 
 
 
265 aa  132  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  31.79 
 
 
310 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  31.37 
 
 
354 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  31.37 
 
 
354 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  32.38 
 
 
369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  31.16 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1577  agmatinase  33.46 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.255139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  31.16 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  31.16 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  31.37 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  31.16 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  31.16 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  30.93 
 
 
365 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  32.1 
 
 
290 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  31 
 
 
318 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  32.1 
 
 
290 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  32.33 
 
 
290 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>