More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1287 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  100 
 
 
299 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  93.98 
 
 
299 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  56.95 
 
 
304 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  63.73 
 
 
296 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  58.25 
 
 
291 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  58.04 
 
 
287 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  54.01 
 
 
293 aa  347  9e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  53.66 
 
 
293 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  54.01 
 
 
293 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  52.45 
 
 
294 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  42.81 
 
 
280 aa  259  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  41.55 
 
 
285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  41.55 
 
 
285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  41.88 
 
 
287 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  42.96 
 
 
289 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  44.04 
 
 
284 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  40.57 
 
 
290 aa  232  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  43.57 
 
 
288 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  39.07 
 
 
288 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  39.21 
 
 
295 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  39.24 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  38.63 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  40 
 
 
287 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  38.04 
 
 
285 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  38.21 
 
 
294 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  39.37 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  37.77 
 
 
296 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  36.14 
 
 
290 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  36.14 
 
 
290 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  36.14 
 
 
290 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  36.14 
 
 
290 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  36.14 
 
 
290 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  36.14 
 
 
290 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  36.14 
 
 
290 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  36.14 
 
 
290 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  35.71 
 
 
291 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  36.14 
 
 
290 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  35.79 
 
 
290 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  35.17 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  36.21 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  34.51 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  35.52 
 
 
282 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  34.83 
 
 
282 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  37.61 
 
 
250 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  35.76 
 
 
297 aa  175  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  38.03 
 
 
290 aa  175  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  34.3 
 
 
283 aa  169  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  36.33 
 
 
291 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.79 
 
 
311 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  34.02 
 
 
291 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  32.44 
 
 
315 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00520  arginase  35.56 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.960091  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  35.85 
 
 
293 aa  155  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  35.85 
 
 
293 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  34.4 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  33.68 
 
 
283 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  33.21 
 
 
287 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  30.88 
 
 
320 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  33.21 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  32.71 
 
 
305 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1313  agmatinase  35.69 
 
 
293 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501351  normal  0.021834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  31.18 
 
 
327 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  31.47 
 
 
319 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  31.47 
 
 
319 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  31.47 
 
 
319 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.97 
 
 
316 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  35.34 
 
 
293 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  36.3 
 
 
289 aa  149  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  32.75 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  30.77 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.86 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  30.91 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  32.5 
 
 
319 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  32.6 
 
 
316 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  32.6 
 
 
320 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  30.82 
 
 
318 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  32.6 
 
 
320 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  30.18 
 
 
324 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  32.6 
 
 
320 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  30.36 
 
 
329 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  32.66 
 
 
318 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  29.54 
 
 
324 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  31.51 
 
 
342 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2696  agmatinase  30.41 
 
 
305 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  31.77 
 
 
318 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.57 
 
 
312 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.3 
 
 
305 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2044  agmatinase  33.95 
 
 
301 aa  142  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.661997  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  31.41 
 
 
329 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  33.33 
 
 
310 aa  142  9e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  31.41 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  31.18 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  31.41 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  33.45 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3780  putative agmatinase  32.3 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.547694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  31.29 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  31.21 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  32.25 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  31.41 
 
 
354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  31.41 
 
 
354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>