More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0516 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  63.74 
 
 		 284 aa  377  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  58.78 
 
 		 280 aa  348  5e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  56.29 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  48.03 
 
 		 289 aa  270  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  49.82 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  48.38 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  48.38 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  48.38 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  48.38 
 
 		 290 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  48.38 
 
 		 290 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  46.26 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  48.74 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  48.01 
 
 		 290 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  48.01 
 
 		 290 aa  261  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  48.01 
 
 		 290 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  49.1 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  48.01 
 
 		 290 aa  261  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  46.98 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  47.29 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  45.45 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  45.3 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  44.56 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  43.46 
 
 		 290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  40.49 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  42.35 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  44.33 
 
 		 283 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  45.85 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  41.55 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  41.07 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  45.49 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  44.48 
 
 		 282 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  42.65 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  40.48 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  43.59 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  43.59 
 
 		 288 aa  225  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  39.02 
 
 		 294 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  39.72 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  39.72 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  37.94 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  39.02 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  37.41 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  43.11 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  36.88 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.16 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  36.01 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  36.2 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  36.17 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  35.23 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  34.27 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  37.36 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  35 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  31.63 
 
 		 316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  32.86 
 
 		 319 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.86 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  33.68 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  32.84 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  33.69 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  32.71 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  33.09 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  33.46 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  33.09 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  31.85 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  31.85 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  31.85 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  31.85 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  33.7 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  32.23 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  33.93 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  31.25 
 
 		 322 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  32.34 
 
 		 318 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  34.29 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  33.69 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  32.34 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  32.5 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  32.34 
 
 		 354 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  33.46 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  31.97 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  32.34 
 
 		 354 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  34.25 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  30.37 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  31.97 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  32.34 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  32.27 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  32.25 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  31.96 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  31.96 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  34.29 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  31.96 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  31.6 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  30.18 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  32 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  34.67 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  31.6 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  32.06 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  31.97 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  30.37 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  31.23 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  33.46 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>