More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0489 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  100 
 
 
288 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  59.3 
 
 
287 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  60.87 
 
 
285 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  58.27 
 
 
289 aa  337  9e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  54.7 
 
 
294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  54.01 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  53.05 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  53.05 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  53.05 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  53.05 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  55.84 
 
 
295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  52.69 
 
 
290 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  52.69 
 
 
290 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  52.69 
 
 
290 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  52.69 
 
 
290 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  52.69 
 
 
290 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  52.69 
 
 
290 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  51.97 
 
 
290 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  52.14 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  50.55 
 
 
285 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  52.69 
 
 
296 aa  301  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  53.82 
 
 
288 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  52.13 
 
 
288 aa  298  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  46.91 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  46.98 
 
 
285 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  46.98 
 
 
285 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  46.27 
 
 
284 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  43.27 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  45.09 
 
 
250 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  41.67 
 
 
279 aa  228  9e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  41.82 
 
 
291 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  41.79 
 
 
283 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  40.99 
 
 
282 aa  221  8e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  39.36 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  41.3 
 
 
287 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  37.63 
 
 
299 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  39.64 
 
 
282 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  39.07 
 
 
299 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  38.99 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  39.35 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  41.09 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  40 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  38.99 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  38.27 
 
 
294 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  37.41 
 
 
291 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  38.87 
 
 
289 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  35.09 
 
 
297 aa  178  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  39.26 
 
 
293 aa  176  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  37.13 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  34.93 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  36.76 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  34.52 
 
 
320 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  34.52 
 
 
320 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  34.52 
 
 
316 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  34.52 
 
 
320 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  38.24 
 
 
318 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  36.03 
 
 
329 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  37.5 
 
 
306 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  38.29 
 
 
318 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.98 
 
 
319 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  37.92 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  36.03 
 
 
342 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  36.27 
 
 
322 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.79 
 
 
315 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  37.92 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  37.92 
 
 
354 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  37.92 
 
 
354 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  36.2 
 
 
310 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  33.57 
 
 
319 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  33.57 
 
 
319 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  33.57 
 
 
319 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  37.92 
 
 
318 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  34.66 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  36.43 
 
 
329 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  36.19 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  34.18 
 
 
306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  36.17 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  33.69 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  35.44 
 
 
318 aa  162  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  36.14 
 
 
330 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  34.55 
 
 
337 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  35.25 
 
 
306 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  33.81 
 
 
309 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  35.77 
 
 
320 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  34.69 
 
 
315 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  34.75 
 
 
326 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  34.75 
 
 
326 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  34.75 
 
 
326 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  36.47 
 
 
305 aa  159  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  34.98 
 
 
318 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  36.26 
 
 
316 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  37.59 
 
 
310 aa  159  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  35.59 
 
 
321 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  35.34 
 
 
315 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  33.7 
 
 
354 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  35.9 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  36.03 
 
 
319 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  33.57 
 
 
378 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  34.89 
 
 
283 aa  156  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  34.2 
 
 
329 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>