More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1978 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  100 
 
 
250 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  59.57 
 
 
290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  52.08 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  45.09 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  45.77 
 
 
296 aa  235  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  42.86 
 
 
285 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  46.26 
 
 
289 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  44.89 
 
 
285 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  48.46 
 
 
290 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  48.46 
 
 
290 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  48.46 
 
 
290 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  48.9 
 
 
290 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  48.46 
 
 
290 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  48.46 
 
 
290 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  48.46 
 
 
290 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  48.02 
 
 
290 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  48.02 
 
 
290 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  48.02 
 
 
290 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  48.02 
 
 
290 aa  215  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  48.07 
 
 
291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  47.64 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  48.36 
 
 
288 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  45.31 
 
 
288 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  47.64 
 
 
295 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  42.17 
 
 
280 aa  198  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  43.42 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  43.11 
 
 
285 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  43.11 
 
 
285 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  44.05 
 
 
284 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  38.5 
 
 
299 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  43.11 
 
 
282 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  42.67 
 
 
282 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  42.92 
 
 
291 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  37.8 
 
 
283 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  42.86 
 
 
287 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  41.78 
 
 
282 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  37.61 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  35.37 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  38.84 
 
 
297 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  39.47 
 
 
296 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  34.96 
 
 
293 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  35.09 
 
 
293 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  39.3 
 
 
304 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  33.77 
 
 
293 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  37.19 
 
 
289 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  33.33 
 
 
294 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  39.27 
 
 
291 aa  150  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  40.08 
 
 
283 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  34.98 
 
 
290 aa  145  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  37.04 
 
 
283 aa  142  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  38.53 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  38.96 
 
 
287 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  35.47 
 
 
310 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  38.24 
 
 
317 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.92 
 
 
315 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  36.33 
 
 
354 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  34.58 
 
 
329 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  36.33 
 
 
354 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  36.48 
 
 
318 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  35.04 
 
 
316 aa  131  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  38.02 
 
 
309 aa  131  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  30.93 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  38.84 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  37.65 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  36.48 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  35.25 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1206  agmatinase  37.71 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  35 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  34.89 
 
 
330 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  34.58 
 
 
342 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  36.71 
 
 
318 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  36.71 
 
 
318 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  35.86 
 
 
317 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  36.17 
 
 
321 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  35.86 
 
 
329 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  35.86 
 
 
317 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  35.86 
 
 
317 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  35.86 
 
 
317 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  35.86 
 
 
317 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  33.61 
 
 
319 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  35.86 
 
 
317 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  34.82 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  35.15 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  35.15 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  35.15 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  33.76 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  36.33 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  35.04 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  39.08 
 
 
318 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  40 
 
 
356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  36.29 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  32.56 
 
 
293 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  34.33 
 
 
316 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  37.92 
 
 
317 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  35.32 
 
 
306 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  33.88 
 
 
315 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1603  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40 
 
 
266 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.293668  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  37.1 
 
 
322 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  35.29 
 
 
354 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.91 
 
 
316 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>