More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3350 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  91.07 
 
 
291 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  83.45 
 
 
290 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  83.45 
 
 
290 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  83.45 
 
 
290 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  83.45 
 
 
290 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  82.76 
 
 
290 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  83.1 
 
 
290 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  83.1 
 
 
290 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  83.45 
 
 
290 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  83.1 
 
 
290 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  83.1 
 
 
290 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  83.45 
 
 
290 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  62.5 
 
 
295 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  55.48 
 
 
285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  54.7 
 
 
288 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  52.35 
 
 
289 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  52.14 
 
 
287 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  51.23 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  48.92 
 
 
285 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  47.48 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  48.74 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  48.74 
 
 
285 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  45.8 
 
 
290 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  46.74 
 
 
287 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  47.65 
 
 
280 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  50.72 
 
 
288 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  45.59 
 
 
284 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  45.82 
 
 
282 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  45.45 
 
 
282 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  44.6 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  43.17 
 
 
283 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  37.5 
 
 
299 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  37.77 
 
 
291 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  40.29 
 
 
279 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  38.85 
 
 
287 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  47.64 
 
 
250 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  37.5 
 
 
299 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  35.94 
 
 
296 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  34.84 
 
 
304 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  35.24 
 
 
320 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  36.73 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  35.71 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  36.98 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  33.33 
 
 
294 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  36.88 
 
 
315 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  38.68 
 
 
325 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  36.42 
 
 
324 aa  178  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  37.46 
 
 
327 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  35.28 
 
 
322 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  37.2 
 
 
318 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  38.38 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  38.38 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  38.38 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  38.27 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  36.15 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  36 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  34.39 
 
 
319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  34.39 
 
 
319 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  33.81 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  34.04 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  35.27 
 
 
316 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  35.53 
 
 
321 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  38.83 
 
 
321 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  38.6 
 
 
337 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  36.45 
 
 
356 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.47 
 
 
319 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  36.4 
 
 
306 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  32.65 
 
 
316 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  32.65 
 
 
320 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  34.41 
 
 
318 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  36.18 
 
 
329 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  33.82 
 
 
320 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  33.82 
 
 
320 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  35.03 
 
 
378 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  36 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  34.98 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  36.43 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  34.98 
 
 
306 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  36.36 
 
 
319 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  34.69 
 
 
319 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  34.69 
 
 
319 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  34.69 
 
 
319 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  35.34 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  34.35 
 
 
354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  35.97 
 
 
354 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  35.97 
 
 
354 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  34.42 
 
 
315 aa  165  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  36.15 
 
 
315 aa  165  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  35.97 
 
 
318 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  37 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  36.79 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  36.17 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  35.56 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  35.64 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  37.87 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  35.61 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  36.04 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  37.87 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  37.87 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>