More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3566 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  100 
 
 
287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  59.3 
 
 
288 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  56.84 
 
 
289 aa  343  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  54.8 
 
 
285 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  53.21 
 
 
291 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  53.43 
 
 
290 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  53.79 
 
 
290 aa  298  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  53.79 
 
 
290 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  53.79 
 
 
290 aa  297  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  53.79 
 
 
290 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  53.43 
 
 
290 aa  297  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  53.79 
 
 
290 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  52.92 
 
 
285 aa  297  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  52.14 
 
 
294 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  53.43 
 
 
290 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  53.43 
 
 
290 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  52.9 
 
 
288 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  53.43 
 
 
290 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  53.43 
 
 
290 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  53.65 
 
 
295 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  51.96 
 
 
296 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  46.98 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  48.75 
 
 
290 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  44.72 
 
 
287 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  45.3 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  45.3 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  50.81 
 
 
250 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  43.27 
 
 
280 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  41.84 
 
 
282 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  41.49 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  43.37 
 
 
279 aa  236  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  41.13 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  40.21 
 
 
283 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  43.17 
 
 
284 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  41.01 
 
 
291 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  40.73 
 
 
287 aa  217  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  39.72 
 
 
293 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  40 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  40 
 
 
299 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  38.93 
 
 
293 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  38.99 
 
 
294 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  38.57 
 
 
293 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  38.18 
 
 
296 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  38.18 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  39.08 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  39.18 
 
 
293 aa  182  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  37.46 
 
 
315 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  38.3 
 
 
291 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  38.75 
 
 
315 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  37.09 
 
 
318 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  37.54 
 
 
319 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  37.54 
 
 
319 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  37.54 
 
 
319 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  38.57 
 
 
325 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  36.4 
 
 
319 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  36.4 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  35.53 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  38.21 
 
 
329 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  35.48 
 
 
319 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  35.77 
 
 
306 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  37.41 
 
 
310 aa  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  35.58 
 
 
310 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  34.56 
 
 
316 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  36.17 
 
 
290 aa  169  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  37.23 
 
 
354 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  37.23 
 
 
354 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  36.1 
 
 
316 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  36.96 
 
 
330 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  38.38 
 
 
315 aa  168  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  35.84 
 
 
354 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  34.04 
 
 
316 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  37.5 
 
 
318 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  34.56 
 
 
320 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  36.88 
 
 
318 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  34.56 
 
 
320 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  34.04 
 
 
320 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  37.45 
 
 
306 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  36.43 
 
 
324 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  36.88 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  37.5 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  36.92 
 
 
322 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  38.04 
 
 
317 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  36.17 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  34.04 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  36.76 
 
 
329 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  35.04 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  35.36 
 
 
378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  35.16 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  38.89 
 
 
324 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  36.17 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  35.84 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  36.82 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  37.59 
 
 
318 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  35 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  36.52 
 
 
324 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  37.89 
 
 
306 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  37.89 
 
 
306 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  37.55 
 
 
306 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  37.55 
 
 
306 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  37.94 
 
 
306 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>