More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1626 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1626  agmatinase  100 
 
 
265 aa  536  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0897  putative agmatinase  81.89 
 
 
268 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.322484  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1431  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  83.02 
 
 
268 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1823  putative agmatinase  80.38 
 
 
268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.397511  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  42.6 
 
 
305 aa  195  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  39.18 
 
 
285 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  37.45 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  41 
 
 
284 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  41.48 
 
 
290 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  36.82 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  34.72 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  37.93 
 
 
288 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  35.69 
 
 
310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  33.71 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  35.69 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  37.32 
 
 
285 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  37.32 
 
 
285 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  35.29 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  35.16 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  39.55 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  32.27 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.96 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  38.02 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  35.09 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  34.3 
 
 
321 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  34.62 
 
 
290 aa  128  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  36.33 
 
 
315 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  34.2 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  38.15 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  36.82 
 
 
320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  34.57 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  34.2 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  34.2 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  34.57 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  34.2 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  34.57 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  34.2 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  34.57 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  33.09 
 
 
337 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55948  arginase  33.55 
 
 
362 aa  125  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.79052  normal  0.29627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  36.59 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  35 
 
 
327 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  37.16 
 
 
283 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  34.97 
 
 
324 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  37.45 
 
 
306 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  33.81 
 
 
318 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  36.1 
 
 
345 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.84 
 
 
315 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  33.33 
 
 
318 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.28 
 
 
319 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  36.07 
 
 
319 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  32.74 
 
 
321 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  35.88 
 
 
287 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  35.74 
 
 
369 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  32.37 
 
 
296 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  34.53 
 
 
319 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  35.02 
 
 
329 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  37.26 
 
 
296 aa  121  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  36.67 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  32.37 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  34.47 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  32.37 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  32.37 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  32.96 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  35.97 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  33.93 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  33.81 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  38.11 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  35.69 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  33.93 
 
 
320 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  32.84 
 
 
282 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  33.93 
 
 
320 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  33.93 
 
 
316 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  33.93 
 
 
320 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1603  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.13 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.293668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  32.98 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  32.98 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  32.98 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  32.98 
 
 
324 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  35.09 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  33.33 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  36.09 
 
 
316 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  34.31 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.6 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  33.33 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  33.08 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  35.36 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  33.33 
 
 
315 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  33.93 
 
 
318 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  32.23 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  31.7 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  33.58 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  33.22 
 
 
318 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  35.02 
 
 
333 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  33.21 
 
 
354 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  33.21 
 
 
354 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  33.72 
 
 
309 aa  116  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  33.81 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  33.81 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  33.81 
 
 
345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>