258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1261 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1261  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424073  normal  0.51909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2917  flagellin-like protein  37.54 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  24.44 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  31.32 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  26.8 
 
 		 300 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  26.74 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  26.53 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  24.74 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  37.1 
 
 		 410 aa  79  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  27.65 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.21 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  28.57 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  29.5 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  27.64 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.01 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  27.84 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  24.92 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  23.86 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  23.3 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  25.45 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  25.27 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  25.89 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  23.79 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  25.99 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  23.43 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  27.27 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  25.61 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  24.91 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  30.7 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  23.27 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  25.57 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  24.22 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  26.48 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.73 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  24.64 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  24.32 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  23.76 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  23.59 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  25.61 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  28.28 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  26.51 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  28.7 
 
 		 439 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1662  flagellin-like protein  36.56 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  25.91 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  25.33 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  23.72 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  26.88 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  22.87 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  35.85 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1475  flagellar filament core protein  23.16 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  25.98 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  26.06 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  24.05 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0247  flagellar hook-associated protein FlgL  26.98 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  24.07 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  24.8 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4714  flagellin domain protein  26.05 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0875271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  24.67 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0073  flagellar hook-associated protein 3 FlgL  37.8 
 
 		 409 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  25.4 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1709  flagellar hook-associated protein 3  37.8 
 
 		 409 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.0295245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  24.16 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  27.83 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  29.01 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0382  flagellin protein  28.85 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.768637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  27.73 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  26.89 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  30.56 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  30.56 
 
 		 402 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  26.06 
 
 		 408 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  31.93 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  27.83 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  27.83 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  24.41 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  25.65 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  23.64 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0194  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  24.02 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  22.36 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.45 
 
 		 404 aa  53.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.69 
 
 		 400 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1583  flagellin domain-containing protein  24.79 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  26.55 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  21.4 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.73 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  23.59 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  25.19 
 
 		 530 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  24.35 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  26.69 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0387  flagellin domain-containing protein  27.02 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257256  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  23.59 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  32.11 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  31.48 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  24.02 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  25 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  24.81 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  26.4 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  25.98 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.414815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>