More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0329 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
295 aa  600  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  69.83 
 
 
297 aa  431  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  51.97 
 
 
304 aa  318  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  51.97 
 
 
304 aa  316  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  42.47 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  32.89 
 
 
297 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  34.65 
 
 
297 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  29.21 
 
 
315 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  29.34 
 
 
328 aa  152  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  31.89 
 
 
301 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  29.68 
 
 
309 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  29.87 
 
 
301 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  28.76 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  28.66 
 
 
301 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  31.89 
 
 
298 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  29.45 
 
 
305 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  28.79 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  29.08 
 
 
302 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  26.91 
 
 
298 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  26.75 
 
 
305 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 
299 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.1 
 
 
294 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  29.32 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  24.75 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  25.41 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  26.64 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  24.15 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  24.01 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1295  lagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
740 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.7 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  25.82 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  35.17 
 
 
416 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  28.25 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  29.17 
 
 
1008 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  26.06 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.06 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  26.06 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.73 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  25.7 
 
 
870 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25.73 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  27.68 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  31.76 
 
 
523 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  29.66 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  23.24 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  25.73 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  25.73 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  29.64 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  22.29 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  33.09 
 
 
504 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  27.92 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  20.79 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  23.65 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  31.25 
 
 
532 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  27.91 
 
 
594 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  27.51 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  30.99 
 
 
514 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  21.71 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  29.49 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0683  flagellar hook-associated protein  29.45 
 
 
947 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  29.49 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  22.7 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  22.48 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  26.12 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  25.35 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  29.66 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.55 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  20.98 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  20.46 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  27.56 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.56 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1037  flagellar hook-associated protein FlgL  31.13 
 
 
701 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.908763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  24.43 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.66 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  21.86 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  24.15 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  20.98 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  26.92 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  28.47 
 
 
507 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  26.92 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  34.51 
 
 
475 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.77 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.08 
 
 
411 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.64 
 
 
410 aa  68.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0966  lagellar hook-associated protein FlgL  29.03 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  20.28 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  34.51 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  26.28 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  27.98 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0894  lagellar hook-associated protein FlgL  29.03 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  30.65 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>