More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0990 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
298 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  38.61 
 
 
303 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  35.97 
 
 
305 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  37.33 
 
 
298 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  36.07 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  35.35 
 
 
292 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  36 
 
 
296 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  35.05 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  32.52 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  35.22 
 
 
297 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  33.22 
 
 
302 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  31.66 
 
 
315 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  32.01 
 
 
301 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  32.59 
 
 
305 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  33.66 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  32.35 
 
 
297 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
302 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  33.02 
 
 
301 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  27.27 
 
 
327 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  27.12 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  27.36 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  26.99 
 
 
325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  27.04 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  29.26 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  26.91 
 
 
295 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  29.04 
 
 
298 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.09 
 
 
294 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  29.82 
 
 
292 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
299 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  24.13 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  26.4 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0209  flagellar hook-associated protein 3  30.32 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  24.14 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  26.25 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  26.71 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  25.9 
 
 
302 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
311 aa  85.9  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  27.9 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  25.4 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  25.28 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  26.48 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.28 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  25.99 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  25.56 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.38 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  24.54 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  30.43 
 
 
523 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  25.18 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  25.18 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  28.3 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  31.29 
 
 
507 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  32.69 
 
 
562 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  24.59 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  28.19 
 
 
1008 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1019  flagellar hook-associated protein 3  20.25 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  26.92 
 
 
870 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  24.45 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.9 
 
 
420 aa  72.4  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  23.72 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.31 
 
 
408 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  24.45 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.2 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  24.43 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  27.54 
 
 
504 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  26.89 
 
 
594 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  24.43 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.73 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  23.78 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.1 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  24.1 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  29.27 
 
 
438 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  27.63 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  28.11 
 
 
521 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  27.3 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  30.48 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1552  flagellar hook-associated protein  33.33 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  24.1 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.19 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  23.45 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  23.72 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.62 
 
 
326 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  27.33 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  23.72 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  24.91 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  23.72 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  23.72 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  23.72 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  26.88 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  26.88 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  24.15 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  28.43 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0968  flagellin domain protein  27.47 
 
 
801 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.743409  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.91 
 
 
410 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  32.64 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  27.95 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>