223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2240 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
310 aa  617  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  31.45 
 
 
305 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  31.91 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 
298 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  29.76 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  30.18 
 
 
292 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  31.38 
 
 
296 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.52 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  30.13 
 
 
299 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  27.27 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  29.31 
 
 
295 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 
306 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 
301 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  28.91 
 
 
303 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  26.28 
 
 
315 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  23.71 
 
 
309 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  26.45 
 
 
306 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  34.71 
 
 
420 aa  98.6  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  26.53 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  25.64 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  27.06 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.39 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  24.92 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  28.62 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  24.15 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  25.42 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.65 
 
 
326 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.82 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.4 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  27.42 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  25.83 
 
 
298 aa  89.4  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  26.78 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  29.29 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  29.57 
 
 
400 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  25.76 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  26.24 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  27.81 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  24.1 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  31.82 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  27.7 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  26.43 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  23.53 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  26.48 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.35 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  24.68 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  24.68 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  26.52 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  24.27 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  25.51 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  29.94 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  29.88 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  24.5 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  31.84 
 
 
404 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  31.98 
 
 
562 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  27.06 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  25.49 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  26.51 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  22.84 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  23.93 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  32 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  26.29 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  29.76 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  30.06 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0217  flagellar hook-associated protein FlgL  25.65 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  23.63 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.43 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  23.63 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  29.8 
 
 
504 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  26.2 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  22.83 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  22.18 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.46 
 
 
416 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  25.67 
 
 
403 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  22.26 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  25.67 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  26.58 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  25.69 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.81 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  22.79 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  26.79 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  22.34 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  21.34 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  22.79 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  25.31 
 
 
870 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  26.88 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  27.22 
 
 
401 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  22.26 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  34.21 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  23.47 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  24.48 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.13 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>