227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2358 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  38.31 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  40.33 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  39.8 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  37.91 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  35.35 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  34.55 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  36.03 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  30.74 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  32.21 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  27.57 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  32.67 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  27.52 
 
 		 328 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.07 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  26.03 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  27.96 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  26.58 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  28.19 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  27.13 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  27.85 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.61 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  27.61 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  26.62 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  24.46 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  26.57 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.2 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  23.33 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  26.6 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  25.41 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  25.48 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  25.49 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  25.84 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  30.1 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  26.57 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  24 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  25.53 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  24.83 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  30.57 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  27.69 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  27.1 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  26.35 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0209  flagellar hook-associated protein 3  24.92 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  25.16 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1019  flagellar hook-associated protein 3  24.04 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.93 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  24.59 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  24.48 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  23.43 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  28.44 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  31.72 
 
 		 594 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.22 
 
 		 416 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.89 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1261  flagellin domain-containing protein  27.44 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424073  normal  0.51909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  23.78 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  21.19 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  21.91 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  29.82 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  29.51 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  22.58 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  24.16 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.19 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  29.78 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  27.81 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  24.83 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  21.79 
 
 		 870 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  25.55 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.21 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  23.08 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  25.61 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  23.15 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  24.53 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.55 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  27.81 
 
 		 1008 aa  60.1  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  23.08 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  31.46 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0966  lagellar hook-associated protein FlgL  26.16 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1552  flagellar hook-associated protein  26.57 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  29.19 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2917  flagellin-like protein  27.86 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0894  lagellar hook-associated protein FlgL  26.16 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  28.14 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  23.93 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  23.91 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  25.14 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  23.91 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  23.55 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0822  lagellar hook-associated protein FlgL  27.34 
 
 		 744 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>