280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1171 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 401 aa  803    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  63.28 
 
 		 402 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  63.03 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  59.31 
 
 		 403 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  60.3 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  59.8 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  59.55 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  61.1 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  59.8 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  60.05 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  59.31 
 
 		 403 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  57.86 
 
 		 401 aa  485  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  59.1 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  58.6 
 
 		 400 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  56.86 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  58.1 
 
 		 400 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  36.59 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  33 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.23 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 		 397 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  29.38 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.41 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.76 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.71 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.25 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  29.13 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.14 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.26 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  28.54 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  27.63 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  27.38 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.99 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  28.06 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  27.85 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.85 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.85 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  27.85 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.7 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  29.88 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  27.86 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  29.4 
 
 		 403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  26.92 
 
 		 404 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  24.6 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  26.43 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  29.4 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  29.27 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  28.23 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  27.91 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  25.64 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  26.14 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  25.9 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  25.9 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  25.37 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  23.98 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.42 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  26.65 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  25.89 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  33.88 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  29.18 
 
 		 530 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  30.29 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  30.69 
 
 		 562 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  32.98 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  29.57 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  38.06 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 		 317 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  37.42 
 
 		 317 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  29.38 
 
 		 305 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 		 304 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  34.97 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  28.07 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  27.31 
 
 		 521 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  36.73 
 
 		 317 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  36.73 
 
 		 317 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  36.73 
 
 		 317 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  36.73 
 
 		 317 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  36.73 
 
 		 317 aa  93.2  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.86 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  33.74 
 
 		 305 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.5 
 
 		 311 aa  89.7  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  28.31 
 
 		 530 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  31.31 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  29.94 
 
 		 299 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.77 
 
 		 521 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  31.75 
 
 		 316 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1709  flagellar hook-associated protein 3  24.76 
 
 		 409 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.0295245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>