More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2042 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 305 aa  611  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  55.56 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  41.64 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  39.74 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  35.97 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  40.33 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  36.81 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  38.02 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  36.04 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  33.23 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  33.22 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  32.22 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  31.86 
 
 		 315 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  34.52 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  29.35 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  30.25 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  30.39 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  31.6 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  26.36 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  29.55 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  28.62 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  29.25 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  29.25 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  32.9 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  26.75 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  31.48 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  28.87 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  27.6 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.36 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  25.48 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  25.72 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  27.9 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  27.9 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  28.62 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  34.13 
 
 		 438 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0209  flagellar hook-associated protein 3  27.66 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  26.79 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  25.23 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  24.1 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  23.75 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  22.37 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  26.07 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  26.79 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  26.47 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  36.55 
 
 		 504 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  33.57 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  29.93 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  24.73 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  29.86 
 
 		 594 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  27.9 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.67 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  27.46 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  27.46 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  27.82 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  26.86 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  40.5 
 
 		 870 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  27.82 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  31.61 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.17 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  25.74 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  25.74 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  25.74 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2000  flagellar hook-associated protein 3  30.91 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  25.74 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  27.18 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  25.74 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  27.82 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  23.99 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  26.44 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  28.17 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  29.93 
 
 		 523 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  27.08 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  27.76 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  31.44 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  28.06 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  26.88 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  31.18 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  23.15 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  28.38 
 
 		 1008 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.46 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  24.85 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  24.03 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  24.03 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.42 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  28.52 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  31.49 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  27.39 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  31.49 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  26.69 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  39.29 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  24.32 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  24.04 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  24.34 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  29.52 
 
 		 532 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  24.63 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  25.67 
 
 		 562 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  26.03 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>