More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0866 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  100 
 
 
272 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  73.82 
 
 
274 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0760  flagellin-like  74.18 
 
 
274 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3159  putative flagellin  73.09 
 
 
274 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00882995  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  48.62 
 
 
298 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  38.3 
 
 
282 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  43.43 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  42.44 
 
 
276 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  43.07 
 
 
278 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  43.43 
 
 
278 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  41.24 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  37.41 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  40.88 
 
 
279 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  41.45 
 
 
279 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  38.81 
 
 
272 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  40.37 
 
 
314 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  37.13 
 
 
273 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2950  flagellin domain protein  38.01 
 
 
296 aa  168  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1502  flagellin  36.86 
 
 
297 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1709  flagellin  37.54 
 
 
297 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00621943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  38.6 
 
 
275 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1622  flagellin domain protein  38.14 
 
 
295 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1028  flagellin domain protein  38.46 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  39.11 
 
 
274 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  37.13 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  38.14 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0786  flagellin domain protein  36.43 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.130043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0244  flagellin domain protein  37.07 
 
 
298 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0481639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0790  flagellin domain-containing protein  37.54 
 
 
297 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.585349  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  39.39 
 
 
272 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  33.02 
 
 
327 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  40.37 
 
 
273 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1501  flagellin  35.84 
 
 
297 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.888195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2385  flagellin domain protein  36.01 
 
 
315 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1147  flagellin domain-containing protein  37.54 
 
 
297 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.271109  normal  0.29908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2282  flagellin domain protein  37.64 
 
 
295 aa  158  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.581446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  36.96 
 
 
280 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  37.96 
 
 
279 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  38.6 
 
 
272 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  37.31 
 
 
263 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  36.96 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  38.74 
 
 
276 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  36.19 
 
 
263 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2430  flagellin domain protein  34.65 
 
 
308 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2280  flagellin domain protein  37.5 
 
 
295 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1638  flagellin domain-containing protein  34.35 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.588406  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  36.53 
 
 
276 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1475  flagellar filament core protein  31.8 
 
 
285 aa  152  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  36.46 
 
 
278 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  38.06 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  37.21 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  35.25 
 
 
278 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  38.69 
 
 
271 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  38.69 
 
 
271 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  33.1 
 
 
290 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  36.68 
 
 
293 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  39.2 
 
 
272 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  38.32 
 
 
271 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  35.46 
 
 
283 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  36.13 
 
 
279 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  35.07 
 
 
263 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  38.06 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  37.31 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  36.78 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  37.69 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  38.06 
 
 
271 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  35.45 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  35.19 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  36.63 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  35.19 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1004  flagellar filament core protein  32.39 
 
 
286 aa  145  9e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  34.88 
 
 
304 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  34.83 
 
 
295 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1570  flagellin, putative  35.49 
 
 
297 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  35.79 
 
 
273 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  38.13 
 
 
283 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  34.43 
 
 
271 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  36.63 
 
 
273 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  37.87 
 
 
273 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  35.25 
 
 
283 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  36.36 
 
 
275 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1039  flagellin domain protein  32.49 
 
 
278 aa  142  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  37 
 
 
275 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  37 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  38.01 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  38.01 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  33.79 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  36.43 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  35.16 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  37.91 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1583  flagellin domain-containing protein  36.07 
 
 
278 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0102  flagellin domain protein  37.45 
 
 
276 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  34.15 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  34.15 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1477  flagellar filament core protein  32.04 
 
 
286 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  36.63 
 
 
273 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  35.93 
 
 
272 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  37 
 
 
272 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  35.56 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  35.42 
 
 
290 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>