More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0760 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0760  flagellin-like  100 
 
 
274 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  79.56 
 
 
274 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  74.18 
 
 
272 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3159  putative flagellin  77.37 
 
 
274 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00882995  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  49.49 
 
 
298 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  44.32 
 
 
272 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  37.72 
 
 
282 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  40.15 
 
 
276 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  41.88 
 
 
278 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  41.88 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  41.52 
 
 
278 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  41.67 
 
 
279 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  41.3 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  40.36 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  36.9 
 
 
276 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  35.42 
 
 
273 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  39.27 
 
 
274 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  35.9 
 
 
272 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  36.96 
 
 
280 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  36.82 
 
 
275 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2950  flagellin domain protein  38.01 
 
 
296 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  38.15 
 
 
272 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1028  flagellin domain protein  36.24 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1622  flagellin domain protein  37.11 
 
 
295 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0786  flagellin domain protein  36.77 
 
 
295 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.130043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  37.45 
 
 
277 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0244  flagellin domain protein  35.37 
 
 
298 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0481639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  39.02 
 
 
272 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  39.05 
 
 
273 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1502  flagellin  35.49 
 
 
297 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1709  flagellin  35.15 
 
 
297 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00621943  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2282  flagellin domain protein  37.13 
 
 
295 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.581446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  36.67 
 
 
271 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1147  flagellin domain-containing protein  36.52 
 
 
297 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.271109  normal  0.29908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  39.13 
 
 
272 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2280  flagellin domain protein  37.64 
 
 
295 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  35.71 
 
 
283 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  36.53 
 
 
271 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  36.13 
 
 
274 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  36.53 
 
 
271 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0790  flagellin domain-containing protein  36.52 
 
 
297 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.585349  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  36.16 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  36.67 
 
 
271 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1501  flagellin  34.47 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.888195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1570  flagellin, putative  37.2 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940004  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  36.53 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  36.3 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  35.71 
 
 
294 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  37.04 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  37.04 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  34.32 
 
 
271 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  35.4 
 
 
264 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  35.79 
 
 
273 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  35.56 
 
 
272 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2385  flagellin domain protein  35.69 
 
 
315 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2430  flagellin domain protein  33 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  30.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  35.61 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  35.56 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  36.4 
 
 
314 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  35.56 
 
 
272 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  35.9 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  34.89 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  34.32 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  36.16 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  35.77 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  35.9 
 
 
275 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  35.41 
 
 
276 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  34.69 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  34.69 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  35.25 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1582  flagellin domain-containing protein  34.4 
 
 
281 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  36.3 
 
 
287 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1475  flagellar filament core protein  30.88 
 
 
285 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  34.81 
 
 
272 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  37.01 
 
 
283 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  36.16 
 
 
273 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  34.81 
 
 
272 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1638  flagellin domain-containing protein  36.05 
 
 
298 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.588406  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  33.58 
 
 
273 aa  142  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  34.91 
 
 
279 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  35.51 
 
 
275 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  34.81 
 
 
271 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  34.81 
 
 
271 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  33.95 
 
 
273 aa  142  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  33.95 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  36.4 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  34.81 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  33.33 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  36.78 
 
 
286 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  35.21 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  35.21 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  36.72 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  34.14 
 
 
295 aa  138  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0169  flagellin  36.72 
 
 
274 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521055  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  35.93 
 
 
271 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  34.72 
 
 
293 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  34.07 
 
 
272 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  36.95 
 
 
377 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  34.19 
 
 
274 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>