236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1766 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
313 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  30.03 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  31.01 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
326 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  34.67 
 
 
400 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
299 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  28.08 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  28.36 
 
 
401 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  28.7 
 
 
562 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  26.3 
 
 
317 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  26.3 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  26.3 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  26.3 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  25.54 
 
 
305 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 
299 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  26.3 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  24.7 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
404 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  25.39 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  25.99 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 
317 aa  89.4  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  25.64 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  24.09 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  29.28 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  24.53 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  24.53 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
412 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  24.28 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  25.23 
 
 
309 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  30.12 
 
 
407 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  25.93 
 
 
309 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.02 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  26.65 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  26.65 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  30.98 
 
 
439 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  26.89 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  25.65 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  30.21 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  30.58 
 
 
406 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  31.05 
 
 
523 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
521 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25.34 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  24.32 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  28.04 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  32.41 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  26.38 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  26.38 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  22.56 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  23.66 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.41 
 
 
400 aa  79  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.14 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  30.41 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  31.82 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  32.89 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  31.87 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  23.05 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  32.19 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
402 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  31.16 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 
403 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  30.14 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  26.98 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  25.71 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 
403 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  26.96 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  31.25 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  30.82 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  25.86 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  26.51 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  23.3 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  29.22 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  30.52 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  24.54 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  25.91 
 
 
520 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  22.26 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.28 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.28 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1261  flagellin domain-containing protein  25.86 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424073  normal  0.51909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  29.93 
 
 
532 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  22.61 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  23.55 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  26.4 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  28.76 
 
 
1008 aa  70.1  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  25.24 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  24.91 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>