296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2917 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2917  flagellin-like protein  100 
 
 
276 aa  536  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1261  flagellin domain-containing protein  36.49 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424073  normal  0.51909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  26.48 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  23.99 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  26.64 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  22.88 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  22.88 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  27.6 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  22.88 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  21.77 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  33.87 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  25.26 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  22.14 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  36.29 
 
 
562 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  33.33 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  22.14 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  24.13 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  25.18 
 
 
297 aa  72  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  35.71 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  28.35 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  31.82 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  23.99 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.25 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  30.71 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  23.55 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  28.89 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  27.61 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  31.45 
 
 
433 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  26.7 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  25.18 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  26.94 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  25.27 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.69 
 
 
416 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  23.7 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  22.53 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  24.83 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  32.52 
 
 
400 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  25.16 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  24.66 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  24.73 
 
 
294 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  25.59 
 
 
402 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  24.51 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.27 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  25.59 
 
 
402 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  27.99 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.49 
 
 
401 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  26.4 
 
 
520 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.49 
 
 
401 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  25.4 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  25.95 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  23.13 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.95 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.4 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  33.33 
 
 
410 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  26.22 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  28.79 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  23.31 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  22.88 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  25.79 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  25.95 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  31.88 
 
 
406 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  30.28 
 
 
309 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  24.68 
 
 
326 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  24.68 
 
 
326 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  30.83 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  27.86 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  24.68 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  29.93 
 
 
428 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  24.7 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1834  flagellin  24.89 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000481567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  29.49 
 
 
420 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  30.09 
 
 
532 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  25.08 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  25.94 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.66 
 
 
408 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  26.05 
 
 
403 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  21.35 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  22.58 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  26.97 
 
 
272 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  29.88 
 
 
401 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0182  flagellar hook-associated protein FlgL  20 
 
 
424 aa  56.2  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 
400 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  23.26 
 
 
312 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  26.56 
 
 
521 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  25.53 
 
 
396 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 
420 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
524 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.24 
 
 
411 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  25.44 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  22.88 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  26.05 
 
 
403 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  31.03 
 
 
507 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>