More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2242 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  55.99 
 
 		 309 aa  348  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  47 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  46.05 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  39.87 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  39.87 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  36.89 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  38.82 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  36.6 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  36.17 
 
 		 328 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  33.89 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  35.43 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  32.01 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  31.14 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  31.83 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  31.13 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  29.28 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  31.72 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  37.1 
 
 		 870 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  26.27 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  27.74 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  27.92 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  44.52 
 
 		 514 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  28.53 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  28.76 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  29.08 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  27.56 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  30.07 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  27.65 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  27.01 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  25.41 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  27.18 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  28.24 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  30.77 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  30.42 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  30.77 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  30.42 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  37.33 
 
 		 400 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  25.8 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  31.06 
 
 		 507 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  35.21 
 
 		 1008 aa  102  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  32 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  40.91 
 
 		 410 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  36.88 
 
 		 504 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.87 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  34.24 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  26.47 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  35.97 
 
 		 523 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  33.51 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  27.41 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  32.7 
 
 		 439 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  26.89 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  29.62 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  29.62 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  29.62 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  29.62 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  29.62 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  25.5 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  36.88 
 
 		 404 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  34.72 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  31.52 
 
 		 562 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  26.8 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  33.09 
 
 		 438 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  27.54 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0707  flagellin domain protein  28.16 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.478306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  22.77 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.46 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  27.62 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  34.53 
 
 		 594 aa  92.4  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  30.4 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  27.42 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  24.56 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  26.33 
 
 		 287 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  26.33 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  24.84 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  26.05 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  24.77 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  24.51 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  35.66 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  27.18 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  32.12 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  32.12 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0866  flagellin-like  27.24 
 
 		 272 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  34.03 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  25.62 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  27.08 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  25.62 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  30.29 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  25.79 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  34.03 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  34.03 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>