More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0119 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0119  biopolymer transport-like protein  100 
 
 
160 aa  324  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0532523  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0806  biopolymer transport ExbD protein  60.59 
 
 
173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0015  biopolymer transport ExbD protein  49.68 
 
 
162 aa  134  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.75 
 
 
140 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.08 
 
 
143 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  47.1 
 
 
143 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.83 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.83 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.48 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.95 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.48 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.14 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.14 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
142 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.89 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.43 
 
 
139 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.95 
 
 
141 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.67 
 
 
136 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.87 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.77 
 
 
141 aa  104  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.13 
 
 
144 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
136 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
136 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.76 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.42 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.29 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.84 
 
 
142 aa  94.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.77 
 
 
142 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.77 
 
 
142 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.77 
 
 
142 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
142 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.77 
 
 
140 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.77 
 
 
142 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.77 
 
 
142 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.05 
 
 
138 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.77 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  36.24 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.79 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.64 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.62 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.64 
 
 
143 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  35.29 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.79 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.79 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.55 
 
 
140 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  35.25 
 
 
176 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.68 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.53 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.53 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.53 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.86 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.53 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.33 
 
 
135 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.87 
 
 
139 aa  87.8  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.33 
 
 
136 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.29 
 
 
143 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.95 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1936  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.42 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.54 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.09 
 
 
178 aa  84.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.07 
 
 
139 aa  84.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.81 
 
 
176 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
153 aa  84.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.81 
 
 
139 aa  84  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.81 
 
 
172 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.23 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.42 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.19 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.09 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  34 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  33.57 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  39.31 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  33.11 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  28.67 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  33.56 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.89 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  35 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.56 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2118  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0526178  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  36.18 
 
 
139 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.86 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  33.56 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1794  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0014  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.9 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  38.03 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  33.57 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>