90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  100 
 
 		 101 aa  199  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  78.22 
 
 		 110 aa  153  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  74.23 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  66.33 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  62.14 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  69.79 
 
 		 97 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  75.51 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  67.39 
 
 		 105 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  65.98 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  64.21 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  71.72 
 
 		 100 aa  120  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  73.47 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  68.37 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  62.24 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  53.64 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  61.86 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  65.66 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  64.65 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  73.96 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  64.29 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  57.28 
 
 		 109 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  50.43 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  67.01 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  57.66 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  68 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  52.63 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  56.16 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  54.46 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  44 
 
 		 103 aa  85.5  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  45.78 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  43.9 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  38 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  44.05 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  36.84 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  42.86 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  38.54 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  38.54 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  36.46 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  40.4 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  39.39 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  35.05 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  34.02 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  34.02 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  37.8 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  32 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  34.74 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  33.68 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  35.05 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  38.38 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  35.05 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  36.08 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  36.9 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  41.03 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  39.18 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  35.44 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  32.99 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  31.25 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  35.37 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  39.78 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  32.98 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  31.65 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  31.65 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  35.9 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  34.67 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  43.21 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  34.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  34.62 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  34.62 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.02 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  37.97 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2026  protein of unknown function DUF77  39.18 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  32.05 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  32.47 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  35.56 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  29.79 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  31.63 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  33.77 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  32.88 
 
 		 107 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>