102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1840 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  202  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  61.22 
 
 
100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  55.56 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  55.1 
 
 
99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  48.98 
 
 
103 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  44.21 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  38.78 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  38.38 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  44.44 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  40.82 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  45.45 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  43.62 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  39.39 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  45.78 
 
 
101 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  38.78 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  42.35 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  38.04 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  43.9 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  33.67 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  37.36 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  37.76 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  40.91 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  38.95 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  41.3 
 
 
98 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  38.78 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  42.11 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  31.91 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  39.78 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  34.69 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  30.43 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.02 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  44.9 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  35.71 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  28.57 
 
 
99 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  32.99 
 
 
109 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  35.11 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.48 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  30.61 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  27.66 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  32.65 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  37.04 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  42.65 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  41.24 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  33.73 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  33.73 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  27.55 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  38.46 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  27.55 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  30.61 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  27.55 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  32.98 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  32.26 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  30.93 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  41.18 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  32.65 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0743  hypothetical protein  30.93 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  31.96 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  35.8 
 
 
114 aa  50.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0214  hypothetical protein  32.99 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  38.81 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  32.26 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  32.32 
 
 
101 aa  48.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  30.85 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  32.29 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  34.78 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  36.92 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  40.3 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  37.1 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2026  protein of unknown function DUF77  31.63 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  31.63 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  36.07 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  30.85 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  29 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  29 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  37.11 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  25 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  29.03 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  29.79 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  29.79 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0263  hypothetical protein  39.62 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2211  protein of unknown function DUF77  32.99 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2389  hypothetical protein  27.84 
 
 
104 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  27.27 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2594  hypothetical protein  38.6 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  35.42 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  29.47 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  27.27 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>