123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0429 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  100 
 
 
99 aa  202  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  55.67 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  55.1 
 
 
99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  54.74 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  53.06 
 
 
100 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  49.49 
 
 
99 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  41.24 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  40.82 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  46.94 
 
 
100 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  45.36 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  43.75 
 
 
98 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  43.43 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  37.76 
 
 
101 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  43.62 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  40.43 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  38 
 
 
100 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  38.95 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  41.84 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  39.18 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  37.89 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  35.71 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  36.73 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  39.58 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  35.71 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  42.11 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  51.52 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  36.73 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  34.69 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  42.86 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  42.22 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  39.58 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  43.9 
 
 
101 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  44.33 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  43.9 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  32.65 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  46.97 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  45.16 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  31.96 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  34.69 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  35.42 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  42.65 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  34.94 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  31.96 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  37.86 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  28.87 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  38.75 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  34.02 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  38.67 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  38.67 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0743  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  29.59 
 
 
100 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  43.08 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  42.27 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  31.91 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0308  hypothetical protein  35.44 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.30951  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  32.63 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  30.34 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  31.58 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  31.52 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2026  protein of unknown function DUF77  36.73 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  30.85 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  31.91 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  41.82 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  34.67 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  32.43 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  40.98 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  31.18 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  37.5 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  28.4 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  36.36 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  30.34 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  30.34 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  42.55 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  37.5 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  38.27 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  34.41 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  34.41 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  34.41 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  34.41 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  34.41 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>