67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2871 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  249  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  79.8 
 
 
117 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  82.65 
 
 
98 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  69.39 
 
 
100 aa  140  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  75.51 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  72.45 
 
 
110 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  55.45 
 
 
114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  63 
 
 
101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  70.71 
 
 
100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  57.14 
 
 
107 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  63.64 
 
 
97 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  61.22 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  58.33 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  59.79 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  60.22 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  63.27 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  63.27 
 
 
98 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  55.34 
 
 
109 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  65.71 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  60.61 
 
 
100 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  69.39 
 
 
98 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  51.55 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  59 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  58.72 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  69 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  60 
 
 
91 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  54.88 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  61.22 
 
 
103 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  57.14 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  40.43 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  45.36 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  44.33 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  45.68 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  36.08 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  45.45 
 
 
101 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  40.23 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  35.42 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  42.17 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  38.46 
 
 
99 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  37.04 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  37.66 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  37.35 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  35.8 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  48.08 
 
 
97 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  37.18 
 
 
99 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  30.3 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  47.06 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  30.1 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  35.05 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  36.26 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  46 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  32.43 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  36.84 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  38.6 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  36.84 
 
 
106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  35.09 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  43.86 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  43.86 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  31.08 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  37.04 
 
 
164 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>