66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3901 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  100 
 
 
100 aa  194  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  87.88 
 
 
102 aa  167  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  74.23 
 
 
98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  76.29 
 
 
98 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  69.07 
 
 
107 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  69.89 
 
 
97 aa  120  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  65.98 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  68.37 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  66.33 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  62.63 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  63.16 
 
 
99 aa  113  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  66.3 
 
 
105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  62.5 
 
 
106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  62.63 
 
 
117 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  64.65 
 
 
101 aa  104  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  70.1 
 
 
98 aa  104  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  46.94 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  53.85 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  50.45 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  64.29 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  56.57 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  55.45 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  44.33 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  60.61 
 
 
127 aa  84  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  51.38 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  46.94 
 
 
99 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  51 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  44.07 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  34.69 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  39.58 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  44.44 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  57.58 
 
 
91 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  40.4 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  52.48 
 
 
116 aa  66.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  42.42 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  35 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  35.35 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  40.86 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  36.36 
 
 
101 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  35.35 
 
 
100 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  23.96 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  34.38 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  29.17 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  31.58 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  30.3 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  29.29 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  35.71 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  29.29 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  35.87 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  41.24 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  34.78 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  34.78 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  37.36 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  37.36 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  37.36 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  37.36 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  37.36 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  37.36 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  37.36 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  32.97 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0308  hypothetical protein  29.79 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.30951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  27.27 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  27.37 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>