54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0308 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0308  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  198  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.30951  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  39.39 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  36.46 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  38.54 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  32.63 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  32.63 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  34.41 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  42.17 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  31.18 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  31.91 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  39.58 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  29.9 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  31.18 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  31.4 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  35.44 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  31.25 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  25.81 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  24.73 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  31.4 
 
 
106 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  30.85 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  28.72 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  25.53 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  24.47 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  28.12 
 
 
98 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  28.72 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  26.6 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  32.63 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  27.84 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  27.84 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  26.6 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  29.29 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  27.84 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  27.96 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  23.66 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  28.87 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  26.26 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  29.79 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  21.28 
 
 
106 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>