76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0711 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  210  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  79.59 
 
 
100 aa  167  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  72.73 
 
 
100 aa  157  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  67.68 
 
 
100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0308  hypothetical protein  39.39 
 
 
98 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.30951  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1592  hypothetical protein  35.11 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  38.04 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  36.17 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  39.13 
 
 
103 aa  60.5  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  38.54 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  34.41 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  31.07 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  34.02 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  31.18 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  34.69 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  31.18 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  34.38 
 
 
97 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  34.04 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  33.7 
 
 
100 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  29.9 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  30.53 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  36.17 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  29.47 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  30.61 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  38.82 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  33.68 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  30.43 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  28.57 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  33.68 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  26.32 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  29.7 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  30.68 
 
 
95 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  33.67 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.68 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  29.35 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  30.11 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  25.26 
 
 
97 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  29.17 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  30.39 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  30.39 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  31.58 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  27.47 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  30.39 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  23.96 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  32.08 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  29.29 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  28.71 
 
 
109 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  46.67 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  34.12 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  30.77 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  30.93 
 
 
98 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  27.17 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  27.78 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  25.25 
 
 
101 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>