64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2334 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  100 
 
 		 95 aa  197  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  87.23 
 
 		 95 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  71.28 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  43.62 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  41.49 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  41.49 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  41.49 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  41.49 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  37.23 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  39.36 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  34.04 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  36.96 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  39.13 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  34.78 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.23 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.23 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.23 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  36.56 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1706  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.579458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  32.26 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0308  hypothetical protein  31.18 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.30951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  34.04 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  32.98 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  31.11 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  30.21 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  31.91 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4983  protein of unknown function DUF77  32.98 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  30.34 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  29.47 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  29.17 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  29.17 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  28.26 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  31.11 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  26.09 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  40.86 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  30.43 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  32.26 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  27.96 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  29.03 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  31.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  29.03 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  25.56 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  28.89 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0743  hypothetical protein  29.03 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  27.66 
 
 		 103 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  31.96 
 
 		 108 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  29.03 
 
 		 108 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  31.91 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  25.56 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1592  hypothetical protein  29.17 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  27.96 
 
 		 104 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>