110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0373 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  95.92 
 
 		 98 aa  197  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  88.78 
 
 		 99 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  80.61 
 
 		 99 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  75.51 
 
 		 107 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  70.41 
 
 		 101 aa  153  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  62.24 
 
 		 101 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  59.18 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  57.14 
 
 		 100 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  53.68 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  53.68 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  44.68 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  43.75 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  44.33 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  54.29 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  41.49 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  40.62 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  43.3 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  40.62 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  41.67 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  43.3 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  35.71 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  38.78 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  38.78 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  39.18 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  44.44 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1706  protein of unknown function DUF77  37.78 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.579458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  40.21 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  40.21 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  38.14 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  37.5 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  39.13 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  34.94 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4983  protein of unknown function DUF77  38.54 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  39.18 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  34.02 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  36 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  36 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  31.18 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  37.11 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  35.87 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  40.4 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  33.7 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  35.87 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  34 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  34.69 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  31.25 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  34.74 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  27.55 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  36.46 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  32.29 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2389  hypothetical protein  30.21 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  35.42 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  43.14 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  35.42 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0743  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  33.67 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  34.02 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  32.69 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0214  hypothetical protein  28.87 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0308  hypothetical protein  25.81 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.30951  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  33.7 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  35.37 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  31.31 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  31.25 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  29.35 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  29.35 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  30.61 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  35.35 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  29.63 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  31.31 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  36.76 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  29.29 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  28.26 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  31.75 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  37.31 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  24.74 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  31.34 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  24.74 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  24.74 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  26.09 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1592  hypothetical protein  26.53 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  33.67 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>