48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0332 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  234  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  75.42 
 
 		 107 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  62.07 
 
 		 114 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  54.31 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  54.24 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  56.25 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  57.26 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  49.57 
 
 		 100 aa  113  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  54.31 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  52.99 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  53.39 
 
 		 101 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  54.7 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  53.85 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  57.02 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  66.2 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  67.16 
 
 		 98 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  61.96 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  62.96 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  62.35 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  58.02 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  62.34 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  63.49 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  60.98 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  55.71 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  54.41 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  44.05 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  48.72 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  40.7 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  56.41 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  50.86 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  42.35 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  37.21 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  37.04 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  35.23 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  36.59 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  52 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  43.75 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  43.75 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  40.62 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  34.09 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  32 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  42.19 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  47.06 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  34.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  48.89 
 
 		 92 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  40.85 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  45.31 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>