89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2417 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  207  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  55.56 
 
 
99 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  55.56 
 
 
100 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  49.49 
 
 
99 aa  101  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  49.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  46.39 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  40 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  43 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  43 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  36.46 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  39.58 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  32.67 
 
 
100 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  41.46 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  38.54 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  36.84 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  35 
 
 
100 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  36.46 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  35.11 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  35.56 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  36 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  35.64 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  32 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  34.69 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  34 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.37 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  30.11 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  36.17 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  36.17 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  36.67 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  33.68 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  34 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  32 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  34 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  33 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  35.42 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  30.3 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  32 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  38.46 
 
 
98 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  33 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  36 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.44 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  39.39 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  36 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  33.66 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  35.37 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  31.87 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  31.63 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  34.38 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  34.02 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0743  hypothetical protein  28 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  30.3 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  28.71 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  30.3 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  32.1 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  27.85 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  31 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  31 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  28.28 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0207  protein of unknown function DUF77  30.93 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1257  protein of unknown function DUF77  27.84 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  35.87 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2026  protein of unknown function DUF77  30.21 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  30.11 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  26.74 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2211  protein of unknown function DUF77  30.93 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  27.06 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  34.85 
 
 
98 aa  42  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  35.38 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  29 
 
 
106 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  26.87 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  35 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  32.29 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  43.4 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2389  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  27.72 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  27.72 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  41.67 
 
 
98 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>