58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4567 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  100 
 
 
109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  72.82 
 
 
97 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  64.08 
 
 
107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  62.14 
 
 
100 aa  125  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  64.08 
 
 
101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  64.65 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  60.58 
 
 
99 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  56.9 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  60 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  53.64 
 
 
114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  61.17 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  56.07 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  65.42 
 
 
125 aa  110  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  62.14 
 
 
98 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  72.06 
 
 
91 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  58.25 
 
 
98 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  57.28 
 
 
107 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  57.28 
 
 
127 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  55.34 
 
 
98 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  56.73 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  55.77 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  61.32 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  44.23 
 
 
103 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  56.31 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  53.4 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  55.34 
 
 
103 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  50.47 
 
 
102 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  38 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  45 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  38.83 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  43.02 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  36.54 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  41.86 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  37.8 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  32.08 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  47.06 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  32.38 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  32.69 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  37.35 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  34.15 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  31.73 
 
 
98 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  35.8 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  41.41 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  36.14 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  35.24 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  42 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  42.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  30.84 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  36.11 
 
 
100 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  32.93 
 
 
100 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  32.14 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  29.63 
 
 
104 aa  40  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  28.57 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>