74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3718 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  100 
 
 
97 aa  197  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  46.74 
 
 
95 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  42.39 
 
 
95 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  43.96 
 
 
95 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  41.94 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  46.74 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  42.86 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  34.38 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  41.94 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  32.29 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  39.13 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  44.09 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  42.11 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1490  hypothetical protein  36.56 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0768  hypothetical protein  35.48 
 
 
97 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0887902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  42.19 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  40.58 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  41.38 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  40.54 
 
 
92 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  31.87 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  30.93 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  30.93 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  31.58 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0453  protein of unknown function DUF77  44.71 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  34.67 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  26.97 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  34.92 
 
 
101 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  30.77 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  29.51 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  34.92 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  36.84 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  34.92 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  36.36 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  31.75 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  31.75 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  25.42 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  24.71 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  35.37 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  26.97 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  29.89 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  31.15 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  29.51 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  30.16 
 
 
99 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  31.76 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  29.79 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  30.16 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  25.56 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  26.76 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  38.6 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  30.16 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  30.68 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  30.95 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  29.11 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  29.51 
 
 
100 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  29.51 
 
 
100 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  29.51 
 
 
100 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  29.51 
 
 
100 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  29.51 
 
 
100 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  29.51 
 
 
100 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  29.51 
 
 
100 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>