38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0434 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  46.32 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  42.39 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  41.05 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  38.3 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  41.24 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  36.17 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  36.17 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  36.17 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  34.74 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  37.23 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  33.73 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  34.38 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  36.46 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  30.93 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  35.42 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1490  hypothetical protein  27.66 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  36.73 
 
 
98 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  30.3 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  26.8 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  26.58 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  30.53 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  30.53 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0768  hypothetical protein  24.47 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0887902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  38.6 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  27.5 
 
 
100 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  30.53 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  31.65 
 
 
100 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.62 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>