74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3206 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  65.59 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  64.52 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  58.95 
 
 
95 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  58.95 
 
 
97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  55.91 
 
 
95 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  51.58 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  49.47 
 
 
95 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  42.39 
 
 
97 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  47.31 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  48.96 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  43.75 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  44.68 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  42.71 
 
 
98 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  37.23 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  34.74 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  34.74 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  27.78 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  27.78 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1490  hypothetical protein  37.5 
 
 
99 aa  58.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  26.67 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  39.33 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  39.19 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0768  hypothetical protein  35.42 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0887902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  36.36 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  36.67 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.34 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.34 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  39.74 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  43.14 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  37.33 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  32.22 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  35.48 
 
 
103 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  27.96 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  36.67 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  36.36 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  30.86 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  37.68 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  35.48 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  35.63 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  26.88 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  35.85 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  35.48 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  36.14 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  30.38 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  41.98 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  22.78 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0453  protein of unknown function DUF77  35.11 
 
 
97 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  31.94 
 
 
100 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  33.87 
 
 
103 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  41.82 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  36.92 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  35.42 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0263  hypothetical protein  32.73 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  26.92 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  28.57 
 
 
101 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>