51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1884 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  100 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0453  protein of unknown function DUF77  51.04 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  38.82 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  37.36 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  40.54 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  31.17 
 
 
101 aa  52  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  32.97 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  32.97 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  31.65 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  40.98 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  31.91 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  46.38 
 
 
97 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  37.66 
 
 
101 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  32.61 
 
 
95 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  30.95 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  33.8 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  31.46 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  40.7 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  44.68 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  31.52 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  36.92 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  37.84 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  45.65 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  42.03 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  26.58 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  32.88 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  26.09 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  34.78 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  27.18 
 
 
103 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  34.62 
 
 
108 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  28.81 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  26.09 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  31.51 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  25.32 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  43.28 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  28.89 
 
 
101 aa  41.2  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  34.25 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  26.09 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  34.09 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  28.57 
 
 
98 aa  40  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>