68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2115 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  72.63 
 
 		 97 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  70.53 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  75 
 
 		 95 aa  133  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  68.42 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  58.95 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  50.54 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  48.39 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  49.48 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  46.74 
 
 		 97 aa  91.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  44.79 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  41.05 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  41.05 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  38.54 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  48.39 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  38.3 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  38.3 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1490  hypothetical protein  36.17 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  37.36 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  37.63 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0768  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0887902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  34.34 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  37.1 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  37.1 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.1 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.1 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  37.1 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  37.1 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  37.1 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.1 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  37.1 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  34.38 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  30.77 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  35.94 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  35.59 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  31.91 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  35.38 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  29.49 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  32.05 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  26.92 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  32.14 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  32.1 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0214  hypothetical protein  31.82 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  27.06 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  36.73 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  28.89 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  29.41 
 
 		 108 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  30.38 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  26.92 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  27.12 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  34.02 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  36.67 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>