33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0859 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  196  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  88.54 
 
 
97 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  88.54 
 
 
97 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  36.67 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  34.78 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  32.5 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  30.53 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  30.53 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  30.53 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  26.67 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  31.58 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  29.47 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  29.47 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  29.47 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  29.47 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  29.47 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  29.47 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  29.47 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  28.42 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  31.87 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  35.29 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  32.26 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  31.11 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  31.11 
 
 
95 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1490  hypothetical protein  32.14 
 
 
99 aa  47  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  31.46 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0768  hypothetical protein  32.14 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0887902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  29.69 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  30.53 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  30.53 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  28.12 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  34.04 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>