60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1484 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  184  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  96.84 
 
 
95 aa  180  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  68.42 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  68.09 
 
 
97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  60.44 
 
 
95 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  49.47 
 
 
95 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  46.74 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  52.58 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  44.57 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  42.86 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  43.16 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  43.16 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  41.86 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  38.54 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  34.38 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  40.32 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0768  hypothetical protein  35.94 
 
 
97 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0887902  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1490  hypothetical protein  34.38 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0859  hypothetical protein  31.11 
 
 
96 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1351  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1377  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.984501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  39.22 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  32.89 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  31.52 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  31.58 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  25.64 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  34.92 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  32.91 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  34.69 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  28.17 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  28.57 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  30.99 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  30.99 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.33 
 
 
100 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  25 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  26.92 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  32.05 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  27.27 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  35.42 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>