75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0453 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  54 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  48.94 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  49.48 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  48.94 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  52.81 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  51.09 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  52.63 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  46.43 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  48.91 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  43.48 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  45.16 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  44.79 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  44.33 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  46.74 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  43.62 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  51.55 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  51.06 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  56.06 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  42.27 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  39.18 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  43.59 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  38.68 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  50 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  42.71 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  41.18 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.04 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  39.78 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  52.94 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  41.67 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  35.42 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  49.25 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  37.11 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  34.57 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  46.43 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  45.1 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  35.05 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  35.87 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  43.14 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  35.63 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  37.84 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  43.14 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  37.84 
 
 		 97 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  31.87 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  31.63 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  39.39 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  31.58 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  33.8 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  31 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  36.07 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  38.96 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  41.82 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  29 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  31.25 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  29.63 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  31.87 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  35.37 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  32.05 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  43.48 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  32.05 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  30.21 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  30.38 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  42.86 
 
 		 99 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>