51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19660 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  225  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  64.55 
 
 
107 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  60.91 
 
 
101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  68.18 
 
 
125 aa  121  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  59.46 
 
 
97 aa  119  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  53.64 
 
 
117 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  59.43 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  58.62 
 
 
120 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  58.72 
 
 
106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  53.64 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  55.45 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  51.79 
 
 
99 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  47.27 
 
 
100 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  53.64 
 
 
109 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  55.45 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  49.17 
 
 
107 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  50.91 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  50.45 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  50.45 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  47.27 
 
 
98 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  50.91 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  55.71 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  49.09 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  43.59 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  44.05 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  49.54 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  50 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  48.53 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  53.64 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  41.44 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  39.53 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  40.74 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  35.29 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  32.93 
 
 
99 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  32.61 
 
 
102 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  35.8 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  38.67 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  40.86 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  35.37 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  32.93 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  37.33 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  32.11 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  34.83 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  32.47 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  34.86 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  32.11 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  30.38 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  44.23 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  43.14 
 
 
98 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  29.91 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  36.67 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>