45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0130 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  54 
 
 
121 aa  120  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  47.87 
 
 
97 aa  90.5  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  47.37 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  50 
 
 
101 aa  83.6  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  42 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  50.57 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  45.16 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  56.72 
 
 
98 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  44.32 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  44.87 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  43.01 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  53.62 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  44.09 
 
 
98 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  44.09 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  40.22 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  47.37 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  44.29 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  48.53 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  50 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  40.4 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  40.4 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  43.48 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  48.33 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  44.44 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  37.76 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  40.85 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  34.69 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  35.71 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  53.73 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  34.94 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  31.31 
 
 
100 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  27.85 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  51.22 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  29.33 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  38.24 
 
 
95 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  37.31 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  35.53 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  35.71 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  30 
 
 
101 aa  42  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  35.85 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  42.65 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  30.68 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>