62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  202  8e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  69.07 
 
 
117 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  66.33 
 
 
101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  64.29 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  71.43 
 
 
98 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  69.39 
 
 
127 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  70.71 
 
 
100 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  62.63 
 
 
98 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  65.96 
 
 
97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  60.42 
 
 
99 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  63.44 
 
 
105 aa  117  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  61.22 
 
 
101 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  58.25 
 
 
107 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  62.63 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  58.59 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  59.62 
 
 
109 aa  113  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  59.6 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  58.42 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  57.58 
 
 
98 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  47.27 
 
 
114 aa  102  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  62 
 
 
98 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  63.77 
 
 
120 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  46.94 
 
 
103 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  52.04 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  54.63 
 
 
125 aa  90.5  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  60 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  44.79 
 
 
121 aa  87  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  60 
 
 
116 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  56.25 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  45.16 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  43.43 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  43.62 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  38.78 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  37.5 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  36.73 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  32.67 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  34.57 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  38.61 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  32.65 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  33.73 
 
 
100 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  30.61 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  29.59 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  29.59 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  48 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  32 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  27.27 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  28.26 
 
 
99 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0434  hypothetical protein  31.65 
 
 
94 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0449  hypothetical protein  31.65 
 
 
94 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0876  protein of unknown function DUF77  30.38 
 
 
98 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13680  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  28.72 
 
 
106 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>