42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1280 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  100 
 
 		 91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  70.13 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  69.14 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  64.47 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  72.06 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  68.92 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  66.23 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  62.34 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  66.2 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  59.74 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  59.74 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  66.67 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  55.29 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  56.96 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  57.65 
 
 		 101 aa  91.3  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  59.09 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  58.14 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  65.75 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  60.32 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  57.14 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  59.46 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  58.11 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  49.21 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  52.05 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  58.44 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  48.61 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  54.32 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  44.44 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  65.08 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  34.94 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  38.96 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  34.15 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  38.46 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  35.71 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  33.71 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  41.07 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  44 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  40.62 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  30.77 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  43.14 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  31.71 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>