88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3684 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3684  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  207  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1047  hypothetical protein  79.59 
 
 		 98 aa  150  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0296792  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  67.31 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3142  protein of unknown function DUF77  75.51 
 
 		 98 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0242067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  69.79 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  71.58 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3901  protein of unknown function DUF77  69.07 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241152  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  71.59 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1667  hypothetical protein  68.37 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.295194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  67.01 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  60.64 
 
 		 99 aa  117  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  59.05 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09450  hypothetical protein  58.59 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102508  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1629  protein of unknown function DUF77  68.04 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0552  protein of unknown function DUF77  57.55 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  65.96 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28510  conserved hypothetical protein TIGR00106  61.86 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.105859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11927  hypothetical protein  65.62 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2871  hypothetical protein  61.22 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0480  hypothetical protein  65.31 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0298607 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19660  hypothetical protein  49.17 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4567  protein of unknown function DUF77  57.28 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0453  hypothetical protein  43.48 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.709089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  42.39 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01800  conserved hypothetical protein TIGR00106  52.25 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3676  protein of unknown function DUF77  57.58 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0799774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1280  protein of unknown function DUF77  60.87 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.331732  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0332  hypothetical protein  42.74 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0130  hypothetical protein  43.01 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.442548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  39.18 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  37.89 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  38.04 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1952  protein of unknown function DUF77  57.43 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  37.89 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  36.46 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  41.41 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  28.12 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  35.56 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0361  hypothetical protein  41.46 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3206  hypothetical protein  39.33 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000217743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0492  hypothetical protein  40.24 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  38.3 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0490  hypothetical protein  40.24 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0423  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0353  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0356  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0380  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4879  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0366  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0445  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  37.8 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  35.42 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  31.11 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  45 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  32.61 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  30 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  30.43 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3718  protein of unknown function DUF77  34.67 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279013  normal  0.0448299 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  45 
 
 		 100 aa  47.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0665  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  29.35 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  35.11 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  30.21 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  38.82 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0668  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154015 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  26.09 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  30.11 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  27.16 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3115  protein of unknown function DUF77  45.1 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00597856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  28.72 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  25.64 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1150  hypothetical protein  30.77 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  32.08 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  32.1 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  42.5 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  25.64 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  34.43 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  44.9 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1102  protein of unknown function DUF77  36.51 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000434388  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  29.9 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  41.25 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  26.73 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  35 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1884  protein of unknown function DUF77  34.09 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  33.33 
 
 		 108 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>