77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1111 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  84.11 
 
 		 109 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  84.11 
 
 		 109 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  60.78 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  59.8 
 
 		 100 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  59.8 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  46.67 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  48.04 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  44.66 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  46.23 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  48.04 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  43.14 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  42.72 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  42.72 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  41.75 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  37.14 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  39.62 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  39.22 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4983  protein of unknown function DUF77  33.98 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  33.01 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  38 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  36.19 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  39 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  34.74 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  34.34 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0214  hypothetical protein  35.35 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2389  hypothetical protein  35.35 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  36 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  35 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  32.69 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  35.24 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  33 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  33.33 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  32 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  31 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0743  hypothetical protein  30.77 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  35.29 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  30.93 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  30.69 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  30.3 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  29.29 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  30.21 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1592  hypothetical protein  31.31 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  29.81 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1818  protein of unknown function DUF77  37 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  30.34 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  33.67 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  29.17 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  29.35 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  28.71 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1257  protein of unknown function DUF77  34.74 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  31.31 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2063  protein of unknown function DUF77  37.5 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000367256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  32.58 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2026  protein of unknown function DUF77  35.29 
 
 		 103 aa  43.5  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  25 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1484  hypothetical protein  28.17 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1754  hypothetical protein  28.17 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0369  hypothetical protein  30.88 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  30.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  27.12 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  26.53 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  29.21 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1099  protein of unknown function DUF77  28.28 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>