62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0323 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  100 
 
 
106 aa  216  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0214  hypothetical protein  78.64 
 
 
103 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2389  hypothetical protein  78.22 
 
 
104 aa  167  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  69.39 
 
 
101 aa  144  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  63.16 
 
 
102 aa  122  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  58.95 
 
 
119 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  36.73 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  38.38 
 
 
104 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  39.39 
 
 
99 aa  76.6  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  33 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  33 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  33 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  37 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  34.69 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  36.36 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  33.01 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  38.38 
 
 
108 aa  66.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  34.34 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  36.14 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  36.14 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  34.94 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  35.87 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  36.46 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4983  protein of unknown function DUF77  36.08 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839266  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  32.29 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  32.65 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  31.96 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  33.73 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  36.79 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  31.25 
 
 
98 aa  53.9  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  30.21 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  29.47 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  29.35 
 
 
100 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  28.57 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  28.87 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  34.38 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  30.12 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  31.91 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1840  hypothetical protein  32.29 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1592  hypothetical protein  31.4 
 
 
98 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  27.17 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  27.96 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  31.31 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2115  hypothetical protein  32.14 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  26.8 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  26.09 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0453  protein of unknown function DUF77  32.08 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  29 
 
 
99 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1871  hypothetical protein  29.33 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  34.69 
 
 
102 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2026  protein of unknown function DUF77  41.18 
 
 
103 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>