53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03500 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  100 
 
 
164 aa  339  8e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  55.71 
 
 
101 aa  94  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  48.75 
 
 
99 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  54.29 
 
 
98 aa  85.1  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  52.86 
 
 
98 aa  84  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  50.68 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  50 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  51.43 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  52.86 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  44.71 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  42.35 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  39.77 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  45.21 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  43.84 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  44.29 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  35.21 
 
 
98 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  26.88 
 
 
119 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  35.06 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  34.85 
 
 
95 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  35.71 
 
 
95 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  41.82 
 
 
99 aa  47.8  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  31.25 
 
 
101 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0176  hypothetical protein  38.98 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797907  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  28.05 
 
 
99 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  32.47 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  31.82 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  26.67 
 
 
100 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  26.67 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  31.25 
 
 
92 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
110 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  35.06 
 
 
101 aa  44.3  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3008  protein of unknown function DUF77  35.82 
 
 
106 aa  44.3  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  42.86 
 
 
103 aa  43.9  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  30.99 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  28.89 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  34.21 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  29.03 
 
 
101 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
103 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  38.78 
 
 
102 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  31.94 
 
 
97 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  25.33 
 
 
100 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2417  hypothetical protein  35 
 
 
99 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1706  protein of unknown function DUF77  31.25 
 
 
96 aa  40.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.579458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>