68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35218 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  58.16 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  47.87 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  43.75 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  43.75 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  41.67 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  41.67 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  39.8 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  40.62 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  38.3 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  37.89 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  36.67 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  36.67 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1706  protein of unknown function DUF77  39.56 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.579458  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  35.35 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  44.29 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  38 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  32.32 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  36.96 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  34.02 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  34.34 
 
 
100 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  38.04 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  32.32 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  32.32 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  32.32 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  32.32 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2138  hypothetical protein  36.25 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0850118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  31.31 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  33.68 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  32.98 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  37.36 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  30.69 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  32.63 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  31.96 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4983  protein of unknown function DUF77  31.31 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839266  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  30.93 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  32.63 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  30.53 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  32.65 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  28.87 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2389  hypothetical protein  30.93 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  29.13 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  29.13 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  32.65 
 
 
108 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  36.17 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  32.32 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  28.87 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  29.59 
 
 
101 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0220  hypothetical protein  31.87 
 
 
100 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.597199  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1592  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  26.8 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0481  hypothetical protein  24.47 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32230  conserved hypothetical protein TIGR00106  32.91 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.420657  normal  0.594264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3264  protein of unknown function DUF77  34.15 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.114548 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  30.77 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0223  hypothetical protein  27.17 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  28.12 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0604  protein of unknown function DUF77  34.18 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568707  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6081  protein of unknown function DUF77  27.85 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0339  protein of unknown function DUF77  29.47 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.577607  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2116  protein of unknown function DUF77  32.5 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>